Virulence factors and clonal relatedness of enterotoxigenic escherichia coli (etec) isolated from children with diarrhoea in Bolivia.
Abstract
Enterotoxigenic Escherichia coli (ETEC) is one of the major causes of diarrhoea in children under five years of age in developing countries and in travellers to these settings. To cause disease, ETEC must be able to colonize the small intestine and produce heat-stable enterotoxin (ST) or heat-labile toxin (LT) or both toxins. The attachment of ETEC is mediated by different fimbrial antigens, known as colonization factors (CFs); at least 22 CFs have been identified to date. Besides determination of the toxins and CFs, serotyping has been used to identify and characterize ETEC. However, there is a lack of rapid and simple standardized methods to detect ETEC in many laboratories. In recent years, PCR-based assays have been increasingly common and due to their simplicity and commercially available reagents for diagnostic purposes with the ability to obtain good specificity and sensitivity.
In order to speed up the detection of CFs by PCR, we have established a multiplex PCR assay for detection of ETEC CFs, using previously established CF primers. The published CF primers were assembled into four panels designed to amplify 19 CFs in four PCR reactions. This test was used to amplified on two ETEC strain collections from Bolivia and Bangladesh isolates from children with diarrhoea........
(Escherichia coli enterotoxigénica ( ETEC ) es una de las principales causas de diarrea en niños menores de cinco años de edad en los países en desarrollo y en los viajeros a estos ajustes. Para causar la enfermedad , de ETEC deben ser capaces de colonizar el intestino delgado y producir enterotoxina estable al calor ( ST ) o toxina lábil al calor ( LT ) o ambas toxinas . La unión de ETEC está mediada por diferentes antígenos fimbriales , conocidos como factores de colonización (CFS) ; al menos 22 FCs se han identificado hasta la fecha . Además de la determinación de las toxinas y los FC , serotipificación se ha utilizado para identificar y caracterizar ETEC . Sin embargo , hay una falta de métodos estandarizados rápidos y simples para detectar ETEC en muchos laboratorios . En los últimos años , los ensayos basados en PCR han sido cada vez más común y debido a su simplicidad y reactivos disponibles comercialmente para fines de diagnóstico con la capacidad de obtener una buena especificidad y sensibilidad .
Con el fin de acelerar la detección de las FC por PCR , hemos establecido un ensayo de PCR multiplex para la detección de ETEC las FC , utilizando primers CF previamente establecidos. Los cebadores CF publicados estaban reunidos en cuatro paneles diseñados para amplificar 19 FCs en cuatro reacciones de PCR. Este ensayo se usó para amplificar en dos colecciones de cepas de ETEC de Bolivia y Bangladesh aislados de niños con diarrea.